Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRP54P61011 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRP54P61011 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRP54P61011 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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