Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCCD1P59942 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms