Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ME1P48163 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ME1P48163 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms