Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms