Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZEB1P37275 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms