Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DESP17661 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DESP17661 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DESP17661 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms