Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms