Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPP2O95045 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms