Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB6

LIMA1, LIM domain and actin-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMA1Q9UHB6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LIMA1Q9UHB6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms