Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2Q9BX26 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms