Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF183Q96D59 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF183Q96D59 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms