Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATG16L2Q8NAA4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms