Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPPQ6IPU0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms