Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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