Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHAF1AQ13111 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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