Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms