Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CSRP3-201ENST00000265968 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MITD1-201ENST00000289359 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HNRNPA1P22-201ENST00000437295 946 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC005050.1-201ENST00000591803 550 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms