Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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