Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms