Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FDFT1P37268 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms