Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms