Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms