Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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