Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP1-5Q9BYS1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms