Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms