Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf72Q96LT7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms