Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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GDPD1Q8N9F7 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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GDPD1Q8N9F7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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GDPD1Q8N9F7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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GDPD1Q8N9F7 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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GDPD1Q8N9F7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GDPD1Q8N9F7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GDPD1Q8N9F7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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