Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms