Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ASPRV1Q53RT3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms