Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms