Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CLPPQ16740 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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