Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ZNF56Q15929 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms