Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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IRF4Q15306 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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IRF4Q15306 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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IRF4Q15306 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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IRF4Q15306 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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IRF4Q15306 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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IRF4Q15306 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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