Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms