Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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FOXF1Q12946 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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FOXF1Q12946 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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