Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK18Q07002 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms