Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPN4P29074 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPN4P29074 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN4P29074 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN4P29074 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN4P29074 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN4P29074 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN4P29074 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTPN4P29074 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN4P29074 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN4P29074 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN4P29074 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPN4P29074 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPN4P29074 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms