Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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