Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYBBP04839 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYBBP04839 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYBBP04839 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYBBP04839 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms