Protein–RNA interactions for Protein: R4GN57

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN57 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GN57 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GN57 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GN57 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GN57 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GN57 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GN57 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GN57 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GN57 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GN57 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GN57 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R4GN57 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GN57 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GN57 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GN57 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GN57 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GN57 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GN57 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GN57 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R4GN57 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
R4GN57 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R4GN57 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R4GN57 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R4GN57 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GN57 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GN57 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GN57 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GN57 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GN57 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GN57 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GN57 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GN57 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GN57 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GN57 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R4GN57 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R4GN57 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R4GN57 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R4GN57 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
R4GN57 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R4GN57 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
R4GN57 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R4GN57 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R4GN57 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R4GN57 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R4GN57 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R4GN57 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R4GN57 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R4GN57 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R4GN57 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R4GN57 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R4GN57 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R4GN57 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R4GN57 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
R4GN57 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R4GN57 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R4GN57 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GN57 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GN57 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GN57 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GN57 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GN57 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GN57 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GN57 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GN57 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GN57 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GN57 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R4GN57 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R4GN57 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R4GN57 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R4GN57 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R4GN57 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R4GN57 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R4GN57 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GN57 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GN57 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GN57 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GN57 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GN57 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GN57 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GN57 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GN57 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GN57 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GN57 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R4GN57 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GN57 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GN57 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GN57 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GN57 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GN57 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GN57 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GN57 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GN57 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GN57 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GN57 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R4GN57 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GN57 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GN57 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GN57 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GN57 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R4GN57 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms