Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC00312Q9Y6C7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms