Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC42Q9Y546 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms