Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED5Q9Y3A6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMED5Q9Y3A6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED5Q9Y3A6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms