Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAN1Q9Y2M0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAN1Q9Y2M0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms