Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX2IPQ9Y2D8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSX2IPQ9Y2D8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSX2IPQ9Y2D8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms