Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PARP4Q9UKK3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PARP4Q9UKK3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PARP4Q9UKK3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PARP4Q9UKK3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PARP4Q9UKK3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PARP4Q9UKK3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PARP4Q9UKK3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PARP4Q9UKK3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms