Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GGA1Q9UJY5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GGA1Q9UJY5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GGA1Q9UJY5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms