Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRLS1Q9UJA2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms