Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRP68Q9UHB9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRP68Q9UHB9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms