Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGXB4Q9UGU5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms